Werkwijze
Het Rekenhof beoordeelt de uitvoering van zijn aanbevelingen standaard op twee momenten. De eerste beoordeling vindt plaats één à twee jaar na publicatie. Die beoordeling steunt op de jaarlijkse beleids- en begrotingstoelichting naar aanleiding van de begrotingsuitvoering, waarin de ministers in de bijlage toelichting geven over hun acties die verband houden met de aanbevelingen van het Rekenhof. Voor de tweede beoordeling, twee à drie jaar na publicatiedatum, bevraagt het Rekenhof ook de geauditeerde.
Als het Rekenhof beslist dat verdere opvolging noodzakelijk is, volgen er, bij rapporten gepubliceerd vanaf 1 januari 2021, nog maximaal drie extra beoordelingsmomenten (doorgaans jaarlijks), zolang niet alle belangrijke aanbevelingen zijn uitgevoerd. Bij rapporten die gepubliceerd werden voor 1 januari 2021, is het aantal beoordelingsmomenten beperkt tot twee of drie.
Monitor opvolging aanbevelingen
Sinds juni 2023 brengt het Rekenhof met een online monitor de voortgang van zijn aanbevelingen in beeld. De monitor bevat onder andere de aanbevelingen die het Rekenhof publiceerde in zijn auditrapporten over de Vlaamse overheid (uitgezonderd financiële producten zoals het rekeningenrapport). Auditrapporten worden tot 7 jaar na hun publicatiedatum bewaard in de monitor. Bij elke aanbeveling staat de recentste beoordelingsstatus die het Rekenhof geeft aan de uitvoering ervan (ten vroegste één jaar na publicatie).
De gegevens van de monitor worden om de zes maanden bijgewerkt.